Der Imperator konsolidiert seine Herrschaft über Terra und erklärt formell seinen Sieg in den Einigungskriegen, was Jahrhunderte des Konflikts beendet. Es wird verstärkt daran gearbeitet, die rationale Staatsideologie der Imperialen Wahrheit auf dem Planeten durchzusetzen.

Da der Imperator erkennt, dass ein Krieg mit den Technokulten des Mars eine lange und kostspielige Angelegenheit wäre, handelt er stattdessen ein Bündnis aus. Im Gegenzug für die Schaffung einer mächtigen Kriegsflotte und das Bereitstellen von Waffen und Maschinen für seine Legionen erhält das Mechanicum unvergleichliche Autonomie als Vasallenstaat des Imperiums und es bleibt ihm frei, seinen Glauben an den Omnissiah auszuüben.

Das größte Meisterwerk des Imperators in Sachen Genmanipulation nähert sich der Vollendung – durch die Kombination aus fortschrittlicher Wissenschaft mit übernatürlichen Geheimnissen erschafft er 20 übermenschliche Kinder, die die perfekten Generäle sein sollen, um seine Legiones Astartes anzuführen. Diese Primarchen werden in Macht und Geschick nur vom Imperator selbst übertroffen, doch kurz vor Fertigstellung des Projekts werden ihre Inkubatoren in der Galaxis verstreut.

Da die entferntesten Winkel des Sol-Systems fest unter der imperialen Kontrolle stehen, beginnen der Imperator und seine Legionen den Großen Kreuzzug. Die ersten Explorator-Flotten verlassen das System, um die umliegenden Sektoren zu beanspruchen und tragen dabei die Hoffnungen der Menschheit mit sich.

Nach Jahrzehnten der Kontroversen rund um die Gefahren psionischer Mächte sitzt der Imperator einem großen Konzil vor, das über ihren Platz im Imperium entscheiden soll. Er verkündet ein Edikt, dass ihren Einsatz durch militärisches Personal des Großen Kreuzzuges untersagt – ausgenommen Astropathen und Navigatoren, die für Reisen durch den Warp unverzichtbar sind.

Während er einen Aufstand niederschlägt, wird Horus durch eine verdorbene Klinge tödlich verwundet. Seine Anhänger bringen ihn zur Schlangenloge auf Davin, wo er während eines dunklen Heilungsrituals einen Pakt mit finsteren Mächten schließt. Obwohl der Kriegsherr aus der Loge vollständig genesen hervorkommt, schwärt in ihm nun die Saat der Verderbnis.

Leman Russ wird entsandt, um seinen Primarchenbruder Magnus den Roten gefangenzunehmen, da dieser gegen das Edikt von Nikaea verstoßen hat. Seine Befehle werden jedoch von Horus manipuliert und der Wolf fällt mit rechtschaffenem Zorn über Prospero, Magnus’ Heimatwelt, her. Die Thousand Sons werden beinahe ausgelöscht, doch ein Riss in der Realität schleudert sie und ihren Primarchen tief in den Warp.

Als Magnus durch verbotene Hexerei von Horus’ Verrat erfährt, versucht er, den Imperator mittels psionischer Projektion zu warnen. Dabei durchbricht er die Schutzvorrichtungen um das Große Werk – einen Kanal in ein extradimensionales Netzwerk, das als Netz der Tausend Tore bezeichnet wird. Dämonen strömen in das Netz und zwingen die Legio Custodes und die Schwestern der Stille in einen jahrzehntelangen Krieg, um das Herz Terras zu schützen.

Da Horus ihn als seinen größten Rivalen sieht, befiehlt er Sanguinius und seine Legion in das Signus-System, weit im Osten des Imperiums. Dort entdecken die Blood Angels Welten, die von jeglichem Leben gesäubert sind – auf Signus Primus gefangen, werden sie von einer Dämonenhorde angegriffen und erleiden schreckliche Verluste, bis ihr Primarch den mörderischen Ka’bandha im Duell bezwingt.

Der Kriegsherr offenbart auf Isstvan III seinen Verrat und merzt in einer apokalyptischen Virusbombenattacke jene Mitglieder verbündeter Legionen – und seiner eigenen – aus, die dem Imperator immer noch treu sind. Trotz seiner Bemühungen liefern ihm einige Überlebende ein letztes Gefecht und die Fregatte Eisenstein kann entkommen, um dem Imperium Bericht zu erstatten.

Während die White Scars am galaktischen Rand fünf Jahre damit beschäftigt sind, Orks zu bekämpfen, entdecken sie, dass die Alpha Legion hinter ihren Problemen steckt. Aus unbekannten Gründen beendet die Alpha Legion ihre Blockade – woraufhin Jaghatai Khan von Horus’ Verrat erfährt. Die White Scars machen sich in größter Eile auf Richtung Terra, wobei sie durch alle Verrätertruppen brechen, die in ihrem Weg sind.

Die Imperial Fists errichten eine Blockade um Cthonia, Heimatwelt der Sons of Horus, aber die Verräter haben sich zu stark eingegraben, um sie von dort zu entfernen. Die VII. Legion hält ihre Besatzung für Jahre aufrecht und verhindert alle Ausbruchsversuche, bis ein Einsatzverband der Sons of Horus eintrifft, um die Belagerung aufzuheben und das Blatt gegen die Söhne Dorns zu wenden.

Rogal Dorn befiehlt eine große Vergeltungsflotte nach Isstvan V, die Horus der Gerechtigkeit überantworten soll. Nach Stunden zermürbender Kämpfe werden die drei loyalen Legionen der Flotte von ihren verräterischen Kameraden hintergangen und inmitten der Urgall-Senke massakriert. Ferrus Manus, Primarch der Iron Hands, wird von Fulgrim im Zweikampf getötet, während Corax entkommt und Vulkan für tot gehalten wird.

Eine wichtige Route durch den Weltraum wird von der Alpha Legion unter ihre Kontrolle gebracht, die unglücklicherweise einer loyalen Kompanie der Iron Warriors begegnet, woraufhin ein unerwartetes und blutiges Gefecht ausbricht. Die Region wechselt im Laufe von fünf Jahren mehrfach den Besitzer, wobei die Kernwelt Paramar V zu wenig mehr als einer verwüsteten Hülle wird.

Die Space Wolves, durch die Schlacht um Prospero stark geschwächt, geraten im gefährlichen Alaxxes-Nebel in einen Hinterhalt der Alpha Legion. Alpharius selbst teleportiert sich an Bord von Leman Russ’ Flaggschiff, wird jedoch so lange aufgehalten, dass ein Raumfort der Dark Angels in den Kampf eingreifen und die Verrätertruppen in die Flucht schlagen kann.

Das Imperial-Fists-Kontingent von Dorns Vergeltungsflotte kommt durch Warpturbulenzen vom Kurs ab und gerät in einen Hinterhalt verräterischer Iron Warriors. Dutzende Großkampfschiffe gehen verloren, da auf beiden Seiten Enteraktionen durchgeführt werden. Die Imperial Fists entern Perturabos Flaggschiff und erringen beinahe den Sieg, als ihnen plötzlich der Rückzug nach Terra befohlen wird.

Die Primarchen Angron und Lorgar führen die Legionen der World Eaters und Word Bearers auf einen Kreuzzug der Vernichtung durch das Reich von Ultramar, die Heimat der Ultramarines, und brennen jede Welt nieder, der ihre Flotte begegnet. Guilliman stellt sich seinen Brüdern auf Nuceria und gebietet ihrem Toben Einhalt, aber nicht bevor finstere Mächte von Angron Besitz ergreifen und ihn in einen dämonischen Avatar des Blutvergießens verwandeln.

Die Legionen der Ultramarines und Word Bearers antworten auf einen Aufruf zur Musterung auf Calth, doch die XVII. hintergeht ihre Brüder und schlachtet sie in großem Stil ab. Obwohl Roboute Guilliman eine wackere Verteidigung organisiert, führen die Machenschaften der Verräter zum Tod des Sterns des Systems und fluten die einst blühende Biosphäre des Planeten mit tödlicher Strahlung.

Befeuert vom Gemetzel auf Calth und des Schattenkreuzzuges, verhindert ein gewaltiges Warpphänomen, das als Untergangssturm bezeichnet wird, Reisen und Kommunikation im Imperium und schneidet ganze Gebiete der Galaxis vom lenkenden Licht des Astronomicans ab. Während die vom Warp berührten Verräter sich frei bewegen können, sind drei Loyalisten-Legionen fern von Terra gestrandet und können nicht bei dessen Verteidigung helfen.

Unter dem Deckmantel von Flüchtlingsflottillen greifen Schiffe der Verräter das Segmentum Solar an und bringen den Krieg an die Türschwelle Terras. Die Alpha Legion gelangt in der Schlacht um Pluto in Schlagweite der Thronwelt, doch Alpharius wird durch Rogal Dorn getötet. Trotzdem scheint die Kommandostruktur der Alpha Legion so stark wie stets zu sein.

Die Dark Angels reagieren auf Berichte von Grausamkeiten, die im gesamten Östlichen Spiralarm verübt werden und sich als das Werk der Night Lords herausstellen. Der von Rache getriebene Konflikt, der folgt, bringt Verheerung über Hunderte imperiale Territorien, endet aber damit, dass Konrad Curze und viele seiner führenden Befehlshaber scheinbar durch den Löwen gefangenen genommen werden, während seine Legion in Dutzende unabhängige Kriegerscharen zerschlagen wird.

Eine uneinnehmbare Festung, die von den Primarchen Perturabo und Fulgrim geschaffen wurde, wird vergeblich von einer Kohorte der Imperialen Garde angegriffen, worauf diese von den Emperor’s Children massakriert wird. Die Verteidiger wiederum müssen feststellen, dass die von ihnen zurückgelassene Festung von der Raven Guard besetzt wurde, die die mächtigen Verteidigungswaffen gegen ihre arroganten ehemaligen Brüder einsetzt.

Baal, Heimatwelt der Blood Angels, wird zu einem Zufluchtsort für Space Marines, die vor Horus’ Rebellion fliehen. Da der Kriegsherr befürchtet, dass die Zerschlagenen Legionen sich neu gruppieren und eine Bedrohung für seine Pläne darstellen werden, belagert er den Planeten, doch jeder Versuch, Baal zu erobern, wird unter großen Verlusten abgewehrt.

Die Iron Warriors starten einen wagemutigen Raumangriff gegen die orbitalen Makropolen von Vanaheim und erobern sie vom Mechanicum. Space Wolves und andere loyale Truppen versuchen, die Einrichtungen zurückzuerobern, doch obwohl unzählige Landungskapseln wie Hagel auf die Makropolen einprasseln, können die Gegenangriffe ihre Ziele nicht erreichen.

Auf den wichtigen Fabrikwelten des Anvillus-Systems bricht ein Krieg der gegenseitigen Auslöschung aus. Seltsamerweise weisen die Magosfürsten Bündnisangebote von Loyalisten und Verrätern gleichermaßen ab und vernichten jeden, der versucht, einzugreifen. Für Außenstehende ist nicht klar, warum sich die verfeindeten Fraktionen bekriegen oder warum der Konflikt ausbrach.

Dutzende Verräterflotten greifen die Systeme des Inwit-Sternhaufens an und wollen die Heimatwelt der Imperial Fists erobern. Die Belagerung spitzt sich über vier Jahre zu, bevor für den direkten Angriff des Kriegsherrn auf Terra Verrätertruppen abgezogen werden. Der Inwit-Sternhaufen bleibt als eine Reihe brennender, verwüsteter Welten zurück.

Die Verräter setzen auf der Ritterwelt Molech eine gewaltige Invasionsstreitmacht ein, darunter vier Titanenlegionen. In einem kritischen Augenblick des Gemetzels offenbart das Ritterhaus Devine seine Treue zu Horus und wendet in einem verräterischen Feuersturm, der das Ende für die imperialen Verteidiger bedeutet, das Blatt in der Schlacht.

Der Eiserne Gürtel, ein Raumgebiet das reich an Fabrikwelten ist, versinkt in einem Morast religiöser Bürgerkriege über die Frage, ob der Imperator der legitime Omnissiah sei. Selbst das apokalyptische Eingreifen der Dark Angels kann das außer Kontrolle geratende Desaster nicht beenden und Schlachten zwischen Fabrikwelten werden noch lange nach dem Ende der Horus-Häresie ausgetragen.

Ein Abflauen des Untergangssturms ermöglicht es Rogal Dorn, viele vormals gestrandete Truppen auf Beta-Garmon zu versammeln, wodurch die größte loyale Truppenkonzentration in der Galaxis entsteht. Horus bleibt keine Wahl und er muss darauf reagieren, wobei beim darauffolgenden Kampf Milliarden Leben verloren gehen, Tausende Schiffe zerstört werden und die Macht der Collegia Titanica so gut wie gebrochen wird.

Die White Scars und Emperor’s Children liefern sich ein temporeiches Gefecht entlang der letzten kritischen Raumrouten, die Terra mit dem nördlichen Imperium verbinden. Die Folgen des Beta-Garmon-Feldzuges bringen verräterische Truppen des Mechanicums und der Sons of Horus auf den Planeten, wodurch sich das Blatt gegen die White Scars wendet und die Loyalisten schließlich von Lorin Alpha vertrieben werden.

Von ihrer Isolation durch den abflauenden Untergangssturm befreit, bringen die Dark Angels in einem Rachefeldzug Verheerung über alle, die Horus treu sind. Sie hinterlassen im südlichen Imperium eine Schneise geschwärzter, verbrannter Welten, darunter die Heimatwelten der Legionen der Emperor’s Children und der Death Guard.

Nach einem unklugen Attentatsversuch gegen den Kriegsherrn Horus werden die verstreuten Space Wolves bis ins Yarant-System verfolgt, wo sie sich einem verzweifelten letzten Gefecht stellen. Leman Russ’ zahlreiche Feinde bringen seine Legion an den Rand der Auslöschung und die Space Wolves werden nur durch das wundersame Eingreifen von Corvus Corax gerettet.

Trotz des scheinbaren Todes ihres Primarchen widersetzt sich die Alpha Legion Horus’ Befehlen und macht sich daran, gen Terra vorrückende Loyalisten aufzuhalten, insbesondere Schiffe der Ultramarines. Um weitere Verluste wichtiger Verstärkung zu verhindern, ist Roboute Guillimans Flotte gezwungen, einzugreifen, wodurch sein Eintreffen bei der Belagerung Terras entscheidend verzögert wird.

Die versammelte Verräterflotte, die vom Kriegsherrn Horus befehligt wird, durchbricht die sorgfältig angelegte Verteidigung des Sol-Systems, zerschmettert die Schlachtflotte durch überwältigende zahlenmäßige Überlegenheit, erobert Luna und erreicht schließlich den Orbit der Thronwelt. Am dreizehnten Tag des Secundus 014.M31 beginnt die Bombardierung Terras …